メンデルの遺伝法則の再発見から時を経ずして発見され始まった染色体の研究は、その１世紀以上の歴史の中で、幾多の先人が、工夫を凝らした独自の手法の開発と実験に取り組んできたことにより発展してきた。我国の植物染色体研究分野では、世界に誇るべき多くの研究者を輩出し、例えば、木原均、下斗米直昌、篠遠喜人、田中信徳、盛永俊太郎、小野知夫、松浦一らがそれぞれの研究分野の進展に国際的に大きな役割を果たしてきた。カンサス州立大学教授　Ｂｉｋｒａｍ　Ｓ．　Ｇｉｌｌ　は、１９９７年開催された国際シンポジウム「植物染色体情報の解析と利用」のプロシーディングス「クロモソーム；植物染色体情報の解析と利用」に寄せた序文で、“Ｊａｐａｎｅｓｅ　ｓｃｉｅｎｔｉｓｔｓ　ｈａｖｅ　ｐｌａｙｅｄ　ａ　ｍａｊｏｒ　ｒｏｌｅ　ｉｎ　ｔｈｉｓ　ｃｅｎｔｕｒｙ　ｏｆ　ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ　ｒｅｓｅａｒｃｈ…”　と述べ、我国研究者の植物染色体研究への貢献を認め、称えている。
植物染色体研究には一部を除いて実験がつきものであり、研究者の心に浮かんだ仮説は実験的に検証されて初めて事実に基づいた知識となり、さらには学問として確立される。得られた実験結果は論文に記載され、集大成された知識は学問として総論や著書で伝えられる。一方、実験結果を再現する上で重要な、植物の取り扱いから試料調整法さらには顕微鏡観察法に至る各過程で集積されている多くの技術や「こつ」は、論文に書かれることなく研究者個人に留まり、場合によっては同学の人たちとも共有されることなく、時間の経過とともに忘れ去られることが少なくない。
私たちは、論文にはあまり記載されない我国研究者の技術的な貢献についても記録し残しておくことが重要だと考え続けてきた。なぜなら、私たち自身が先人から継承した、また時には自分で工夫した技術や「こつ」に助けられて研究を進めてきたからである。また現代生命科学の潮流は明らかに遺伝子から染色体やゲノムへ軸足を移しており、染色体の研究が再び注目されている。したがって、こうした研究動向の中で植物染色体関連の実験書の出版は時機を得ていると判断した。
幸い我国の植物染色体研究を代表する８０余名にのぼる執筆者の方々が、私たちのこうした認識を共有して頂きご協力頂けることとなり、本書の発行となった。（序文より）

第１編　染色体標本作製法
第１章　基本操作
１．　前処理法；２．　切片作成法；３．　押しつぶし法；４．　酵素解離空気乾燥法（ＥＭＡ法）；５．　酢酸カーミン染色法；６．　酢酸オルセイン染色法（１）；７．　酢酸オルセイン染色法（２）（難染色性染色体）；８．　ギムザ染色法；９．　フォイルゲン染色法；１０．　蛍光染色法；１１．　永久標本の作製法；１２．　野外調査での試料調整法

第２章　分染法
１３．　低温分染法；１４．　Ｃバンド法；１５．　Ｎバンド法；１６．　Ｇバンド法；１７．　制限酵素バンド；１８．　銀染色法；１９．　蛍光分染法；２０．　間接蛍光法

第３章　生殖期染色体標本作成法
２１．　パキテン期染色体（ギムザ染色）；２２．　パキテン期染色体（蛍光染色）；２３．　キアズマ観察法；２４．　花粉母細胞の免疫染色；２５．　花粉粒内有糸分裂（小胞子分裂）；２６．　花粉管内有糸分裂（雄原細胞分裂）

第４章　特殊な染色体試料
２７．　糸状菌；２８．　出芽酵母；２９．　分裂酵母；３０．　コケ植物（苔類）；３１．　コケ植物（蘚類）；３２．　シダ植物；３３．　裸子植物；３４．　果樹；３５．　水生植物；３６．　アラビドプシス；３７．　エンレイソウ属植物；３８．　ユリ（減数分裂）；３９．　ラン；４０．　サトイモ；４１．　カヤツリグサ；４２．　ササ・タケ；４３．　牧草類；４４．　インゲンマメ（多系染色体）；４５．　培養細胞

第２編　分子細胞学的手法
第１章　クローニング法
１．　植物ＤＮＡの単離・精製；２．　反復ＤＮＡのクローニング法；３．　トランスポゾンのクローニング法；４．　クロモソームウォーキング法−反復配列を含む領域の解析−；５．　セントロメアの解析；６．　性染色体解析法；７．　人工染色体構築法

第２章　Ｉｎ　ｓｉｔｕハイブリダイゼーション
８．　Ｉｎ　ｓｉｔｕハイブリダイゼーション法；９．　ＰＲＩＮＳ　ｉｎ　ｓｉｔｕハイブリダイゼーション法；１０．　マルチカラー蛍光ｉｎ　ｓｉｔｕハイブリッド法；１１．　ゲノミックｉｎ　ｓｉｔｕハイブリダイゼーション法；１２．　マルチカラーＧＩＳＨ法；１３．　ＤＮＡファイバーＦＩＳＨ法；１４．　ローリングサークル増幅法；１５．　走査電顕加ｉｎ　ｓｉｔｕハイブリダイゼーション法；１６．　透過電顕ｉｎ　ｓｉｔｕハイブリダイゼーション法

第３章　複製解析法
１７．　オートラジオグラフィー法；１８．　ＢｒｄＵ標識法

第４章　染色体タンパク質分析法
１９．　植物染色体の単離・精製法；２０．　ヒストンタンパク質分析法；２１．　ノンヒストンタンパク質分析法

第３編　染色体情報の解析と利用
第１章　染色体情報表記法
１．　核型表記法（間期）；２．　核型表記法（中期）；３．　核型表記法（凝縮型；Ｃｏｎｄｅｎｓａｔｉｏｎ　ｐａｔｔｅｒｎ）；４．　染色体造形像（Ｃｏｎｆｉｇｕｒａｔｉｏｎ）の観察法；５．　対合造形像の頻度分析；６．　パキテン期染色体表記法；７．　定量的染色体地図（ｌｄｉｏｇｒａｍ）作製法；８．　染色体異常系統表記法

第２章　染色体情報解析
９．　顕微分光測光法；１０．　フローサイトメトリー

第３章　画像処理
１１．　アナログ画像（写真）取得・解析法；１２．　デジタル画像取得・解析法；１３．　三次元観察法；１４．　染色体画像データベース

第４章　電子顕微鏡および走査型プローグ顕微鏡
１５．　切片作成法；１６．　走査電子顕微鏡による観察法（ＳＥＭ法）；１７．　免疫電顕染色法；１８．　原子間力顕微鏡による染色体の観察；１９．　原子間力顕微鏡によるＤＮＡの観察；２０．　光プローグ顕微鏡による観察法

第４編　染色体操作
第１章　交配による操作
１．　半数体作出法（Ｂｕｌｂｏｓｕｍ法）；２．　半数体作出法［葯培養法（イネ）］；３．　半数体作出法；葯培養法（コムギ）；４．　イネトリソミックス系統の作出法；５．　イネ相互転座系統の作出法；６．　トリソミックス作出法（ムギ類）；７．　モノソミックス・テロソミックス作出法；８．　遠縁交雑法；９．　各種染色体系統の作出（ブラシカ）

第２章　染色体突然変異誘起法
１０．　倍数体作出法；１１．　染色体異常作出法；１２．　放射線・化学物質処理による小核誘発

第３章　培養による操作
１３．　苗条原基誘導法；１４．　懸濁細胞誘導法；１５．　細胞同調法；１６．　細胞融合法；１７．　ＰＦＰによる染色体減数

第４章　染色体操作・加工法
１８．　植物染色体のソーティング法；１９．　染色体ダイセクション（マイクロマニピュレータ）；２０．　染色体ダイセクション（レーザ法）；２１．　光ピンセット法

第５編　研究支援情報
第１章　植物育成法
１．　アラビドプシス；２．　キク；３．　ユリ；４．　エンレイソウ；５．　イネ；６．　ムギ類

第２章　試薬の調整
７．　前処理液；８．　固定液；９．　解離液；１０．　染色液；１１．　封入剤；１２．　植物細胞用培地；１３．　緩衝液；１４．　写真関係

第３章　染色体資料
１５．　主要植物染色体地図；１６．　主要実験植物染色体数、ゲノム式、ゲノムサイズ

第４章　染色体・ゲノムウェブサイト

索引（和文索引；欧文索引；植物名索引；学名索引）